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Enregistrement W2106308750 · doi:10.1093/jac/dkr572

Validation of novel fluorescence assays for the routine screening of drug susceptibilities of Trichomonas vaginalis

2012· article· en· W2106308750 sur OpenAlexaff
Manal J. Natto, Francesca Savioli, Neils B. Quashie, Christophe Dardonville, Boris Rodenko, Harry P. de Koning

Notice bibliographique

RevueJournal of Antimicrobial Chemotherapy · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueReproductive tract infections research
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesNuffield Foundation
Mots-clésResazurinTrichomonas vaginalisPlate readerHigh-throughput screeningChemistryViability assayPropidium iodideMetaboliteTrichomoniasisBiochemistryBiologyFluorescenceMicrobiologyIn vitroProgrammed cell death

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: To evaluate existing protocols, based on Alamar blue (resazurin), for the routine determination of drug susceptibility in trichomonads, develop new ones and validate these by screening small antiprotozoal libraries. METHODS: The resazurin-based assay was evaluated by determining fluorescence development in Trichomonas media with various cell densities after various intervals and in the presence of metronidazole. Similar investigations were performed with the alternative fluorophores propidium iodide (PI) and resorufin. The optimized protocols were used to screen for new antitrichomonal compounds. RESULTS: Anaerobic cultures of Trichomonas vaginalis rapidly reduced blue resazurin to red, fluorescent resorufin. However, the ascorbic acid in the culture medium produced similar effects, even in the absence of cells, causing high background fluorescence and variability. Moreover, T. vaginalis rapidly metabolized resorufin to the non-fluorescent and colourless metabolite dihydroresorufin, making the fluorescent signal transient. In contrast, resorufin proved to be an excellent viability probe for Trichomonas due to its chemical stability in media and rapid metabolism by the parasite. We also show that staining with PI after cell permeabilization similarly constitutes a reliable measurement of trophozoite numbers. Using the PI and resorufin assays we determined reproducible EC(50) values and identified potent antitrichomonal compounds from a limited screen of phosphodiesterase inhibitors and phosphonium salts. CONCLUSIONS: The resorufin- and PI-based assays are suitable for routine and high-throughput drug screening, whereas resazurin-based assays are not. These assays constitute a major advance in the current protocols as demonstrated by a successful screen for new antitrichomonal lead compounds.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,362

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,311
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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