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Enregistrement W2106312543 · doi:10.1099/jmm.0.46759-0

Rapid detection of Vibrio species using liquid microsphere arrays and real-time PCR targeting the ftsZ locus

2006· article· en· W2106312543 sur OpenAlexafffund
Dobryan M. Tracz, Paul G. Backhouse, Adam B. Olson, Joanne McCrea, Julie A. Walsh, Lai-King Ng, Matthew W. Gilmour

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Microbiology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVibrio bacteria research studies
Établissements canadiensCanadian Science Centre for Human and Animal HealthPublic Health Agency of Canada
Organismes subventionnairesHealth Canada
Mots-clésMicrosphereFtsZLocus (genetics)Real-time polymerase chain reactionMicrobiologyBiologyVibrioChromatographyBacteriaMolecular biologyGeneChemistryGeneticsBacterial protein

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The development of rapid and sensitive molecular techniques for the detection of Vibrio species would be useful for the surveillance of sporadic infections and management of major outbreaks. Comparative sequence analysis of the ftsZ gene in the predominant Vibrio species that cause human disease revealed distinct alleles for each examined species, including Vibrio cholerae, Vibrio parahaemolyticus and Vibrio vulnificus. Light Upon eXtension (LUX) real-time PCR assays were developed to target these species-specific polymorphisms, and were successful in rapidly differentiating the major pathogenic Vibrio species. Luminex liquid microsphere array technology was used to develop a comprehensive assay capable of simultaneously detecting V. cholerae, V. parahaemolyticus and V. vulnificus. These assays permitted the identification of a presumptive V. parahaemolyticus isolate as Vibrio alginolyticus, which was verified using additional molecular characterization.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,350

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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