Characterization of the putative operon containing arylamine <i>N</i>‐acetyltransferase (<i>nat</i>) in <i>Mycobacterium bovis</i> BCG
Notice bibliographique
Résumé
Mycobacterium bovis BCG and Mycobacterium tuberculosis possess a single arylamine N-acetyltransferase whose gene is predicted to occur within a six-gene operon. Deletion of the nat gene caused an extended lag phase in M. bovis BCG and a cell morphology associated with an altered pattern of cell wall mycolates. Analysis of cDNA from M. bovis BCG shows that during in vitro growth all the genes in the putative nat operon are expressed and the open reading frames are contiguous, supporting the existence of an operon. Two genes in the operon, Mb3599c and Mb3600c, are predicted to encode homologues of enzymes annotated as a 2,3-dihydroxybiphenyl 1,2-dioxygenase (bphC5) and a 2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase (bphD2), respectively, in Rhodococcus RHA1. As predicted, M. bovis BCG cell lysates metabolized the BphC substrate 2,3-dihydroxybiphenyl (2,3-DHB) to 2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoic acid (HOPDA), a BphD substrate, which was subsequently hydrolysed. Immunoprecipitation of the BphD homologue from these lysates led to an accumulation of HOPDA. M. bovis BCG growth on both solid and liquid media was inhibited with either 2,3-DHB or an inhibitor of BphC, 3-chlorocatechol (3-CC). In addition, incubation with 2,3-DHB affects the lipid composition of the cell wall resulting in a diminished level of mycolates and an altered cell morphology similar to the Deltanat strain. We propose the enzymes encoded by the putative operon have a similar endogenous role to that of the NAT enzyme and are part of a pathway important for cell wall synthesis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».