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Enregistrement W2106321527 · doi:10.1111/j.1365-2958.2005.04945.x

Characterization of the putative operon containing arylamine <i>N</i>‐acetyltransferase (<i>nat</i>) in <i>Mycobacterium bovis</i> BCG

2005· article· en· W2106321527 sur OpenAlexaff
Matthew C. Anderton, Sanjib Bhakta, Gurdyal S. Besra, Peter Jeavons, Lindsay D. Eltis, Edith Sim

Notice bibliographique

RevueMolecular Microbiology · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilWellcome Trust
Mots-clésOperonBiologyMycobacterium bovisAcetyltransferaseMolecular biologyBiochemistrylac operonGeneEnzymeMicrobiologyPlasmidAcetylationMycobacterium tuberculosisMutantTuberculosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mycobacterium bovis BCG and Mycobacterium tuberculosis possess a single arylamine N-acetyltransferase whose gene is predicted to occur within a six-gene operon. Deletion of the nat gene caused an extended lag phase in M. bovis BCG and a cell morphology associated with an altered pattern of cell wall mycolates. Analysis of cDNA from M. bovis BCG shows that during in vitro growth all the genes in the putative nat operon are expressed and the open reading frames are contiguous, supporting the existence of an operon. Two genes in the operon, Mb3599c and Mb3600c, are predicted to encode homologues of enzymes annotated as a 2,3-dihydroxybiphenyl 1,2-dioxygenase (bphC5) and a 2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase (bphD2), respectively, in Rhodococcus RHA1. As predicted, M. bovis BCG cell lysates metabolized the BphC substrate 2,3-dihydroxybiphenyl (2,3-DHB) to 2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoic acid (HOPDA), a BphD substrate, which was subsequently hydrolysed. Immunoprecipitation of the BphD homologue from these lysates led to an accumulation of HOPDA. M. bovis BCG growth on both solid and liquid media was inhibited with either 2,3-DHB or an inhibitor of BphC, 3-chlorocatechol (3-CC). In addition, incubation with 2,3-DHB affects the lipid composition of the cell wall resulting in a diminished level of mycolates and an altered cell morphology similar to the Deltanat strain. We propose the enzymes encoded by the putative operon have a similar endogenous role to that of the NAT enzyme and are part of a pathway important for cell wall synthesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,027
Score d'incertitude au seuil0,538

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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