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Enregistrement W2106399127 · doi:10.1186/1747-1028-7-13

A conserved histone deacetylase with a role in the regulation of cytokinesis in Schizosaccharomyces pombe

2012· article· en· W2106399127 sur OpenAlexafffund
Charnpal Grewal, Jack W. Hickmott, Stefan Rentas, Jim Karagiannis

Notice bibliographique

RevueCell Division · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFungal and yeast genetics research
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesUniversity of AlbertaMcGill University
Mots-clésSchizosaccharomyces pombeCytokinesisHistone deacetylaseBiologySchizosaccharomycesCell biologyHistoneGeneticsComputational biologyGeneCellSaccharomyces cerevisiaeCell division

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: In Schizosaccharomyces pombe the SET domain protein, Set3p - together with its interacting partners, Snt1p, and Hif2p - form a complex that aids in preventing cell division failure upon mild cytokinetic stress. Intriguingly, the human orthologs of these proteins (MLL5, NCOR2, and TBL1X) are also important for the faithful completion of cytokinesis in tissue culture cells. Since MLL5, NCOR2, and TBL1X form a complex with the histone deacetylase, HDAC3, we sought to determine if an orthologous counterpart played a regulatory role in fission yeast cytokinesis. RESULTS: In this report we identify the hos2 gene as the fission yeast HDAC3 ortholog. We show that Hos2p physically interacts with Set3p, Snt1p, and Hif2p, and that hos2∆ mutants are indeed compromised in their ability to reliably complete cell division in the presence of mild cytokinetic stresses. Furthermore, we demonstrate that over-expression of hos2 causes severe morphological and cytokinetic defects. Lastly, through recombinase mediated cassette exchange, we show that expression of human HDAC3 complements the cytokinetic defects exhibited by hos2∆ cells. CONCLUSIONS: These data support a model in which Hos2p functions as an essential component of the Set3p-Snt1p-Hif2p complex with respect to the regulation of cytokinesis. The ability of human HDAC3 to complement the cytokinesis defects associated with the deletion of the hos2 gene suggests that further analysis of this system could provide insight into the role of HDAC3 in both the regulation of cell division, as well as other biological processes influenced by HDAC3 deacetylation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,245
Score d'incertitude au seuil0,210

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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