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Enregistrement W2106463928 · doi:10.1111/j.1364-3703.2009.00558.x

Patterns of differential gene expression in <i>Brassica napus</i> cultivars infected with <i>Sclerotinia sclerotiorum</i>

2009· article· en· W2106463928 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueMolecular Plant Pathology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant pathogens and resistance mechanisms
Établissements canadiensPlant Biotechnology InstituteAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesSaskatchewan Canola Development CommissionMinistry of Agriculture - Saskatchewan
Mots-clésBiologySclerotinia sclerotiorumWRKY protein domainMYBJasmonic acidGeneMethyl jasmonateGene expressionArabidopsisJasmonateBotanyGeneticsTranscriptomeMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SUMMARY The fungal pathogen Sclerotinia sclerotiorum infects a broad range of dicotyledonous plant species and causes stem rot in Brassica napus. To elucidate the mechanisms underlying the defence response, the patterns of gene expression in the partially resistant B. napus cultivar ZhongYou 821 (ZY821) and the susceptible cultivar Westar were studied using a B. napus oligonucleotide microarray. Although maximum differential gene expression was observed at 48 h post-inoculation (hpi) in both cultivars, increased transcript levels were detected in cv. ZY821 at the earlier stages of infection (6-12 hpi) for many genes, including those encoding defence-associated proteins, such as chitinases, glucanases, osmotins and lectins, as well as genes encoding transcription factors belonging to the zinc finger, WRKY, APETALA2 (AP2) and MYB classes. In both cultivars, genes encoding enzymes involved in jasmonic acid, ethylene and auxin synthesis were induced, as were those for gibberellin degradation. In addition, changes in the expression of genes encoding enzymes involved in carbohydrate and energy metabolism appeared to be directed towards shuttling carbon reserves to the tricarboxylic acid cycle and generating reactive oxygen species. Transcripts from genes encoding enzymes involved in glucosinolate and phenylpropanoid biosynthesis were highly elevated in both cultivars, suggesting that secondary metabolites are also components of the response to S. sclerotiorum in B. napus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,245
Score d'incertitude au seuil0,375

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,180
Écart entre enseignants0,173 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle