MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2106481714

Determining the Role of Wnt Signaling in Zebrafish Oocyte Maturation Through Examination of β-catenin and Dishevelled mRNA Concentrations

2012· article· en· W2106481714 sur OpenAlexvenueno aff
Nathan B. Pincus

Notice bibliographique

RevueSound Ideas (University of Puget Sound) · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueWnt/β-catenin signaling in development and cancer
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Aeronautics and Space Administration
Mots-clésDishevelledZebrafishWnt signaling pathwayOocyteCell biologyCateninMessenger RNABiologyFrizzledSignal transductionChemistryGeneticsGeneEmbryo
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

During oocyte maturation, the oocyte progresses from prophase I to metaphase II of meiosis, and a multitude of other cellular changes occur1. Wnt singaling pathways are known to regulate gene expression, cell behavior, cell adhesion, and cell polarity, as well as play an essential role in embryonic development. Because of this, I am examining the role of Wnt signaling pathways in the earlier process of oocyte maturation, specifically by looking at two Wnt signaling pathway components: β-catenin (ctnnb1) and Dishevelled (dvl2). β-catenin is a an interesting protein to study because it plays a dual role as both a cell adhesion protein when attached to membrane-bound complexes, and a coactivator for transcription by the Wnt pathway when free in the cytoplasm. Dishevelled is the “hub” of Wnt signaling and plays a key role in relaying external signals to internal pathway components. Preliminary research has suggested that β-catenin increases in relative cytoplasmic concentration after maturation, and my findings from last summer showed that this change is not the result of migration from cytoskeleton associated membrane-bound complexes. The first step in my research is to determine a reference gene for zebrafish oocyte maturation, as none are well classified for this specific scenario. I examined β –actin, GAPDH and ef1-α, as these were found to have constant expression during zebrafish embryo development or bovine oocyte development. This will be followed by examining the changes in mRNA concentrations for β-catenin and Dishevelled over the course of oocyte maturation in order to determine the role and importance of the Wnt signaling pathway in this process. Changes in mRNA concentrations are determined through real-time RTPCR analysis. The results of my research will contribute to our understanding of the cellular processes which occur during oocyte maturation, and the importance of signaling pathways such as the Wnt pathway in these processes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueSound Ideas (University of Puget Sound)Même sujetWnt/β-catenin signaling in development and cancerTravaux en français237 207