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Enregistrement W2106492683 · doi:10.1099/mic.0.2006/002519-0

The Lon protease of Pseudomonas aeruginosa is induced by aminoglycosides and is involved in biofilm formation and motility

2007· article· en· W2106492683 sur OpenAlexaff
Alexandra K. Marr, Joerg Overhage, Manjeet Bains, Robert E. W. Hancock

Notice bibliographique

RevueMicrobiology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPseudomonas aeruginosaMicrobiologyTobramycinBiofilmBiologyGentamicinProteaseAntimicrobialAntibioticsGenePathogenHuman pathogenBacteriaEnzymeGeneticsBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pseudomonas aeruginosa is an important nosocomial opportunistic human pathogen and a major cause of chronic lung infections in individuals with cystic fibrosis. Serious infections by this organism are often treated with a combination of aminoglycosides and semi-synthetic penicillins. Subinhibitory concentrations of antibiotics are now being recognized for their role in microbial persistence and the development of antimicrobial resistance, two very important clinical phenomena. An extensive screen of a P. aeruginosa PAO1 luciferase gene fusion library was performed to identify genes that were differentially regulated during exposure to subinhibitory gentamicin. It was demonstrated that subinhibitory concentrations of gentamicin and tobramycin induced a set of genes that are likely to affect the interaction of P. aeruginosa with host cells, including the gene encoding Lon protease, which is known to play a major role in protein quality control. Studies with a lon mutant compared to its parent and a complemented strain indicated that this protein was essential for biofilm formation and motility in P. aeruginosa.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations119
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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