Characterization of a new genotype of avian bornavirus from wild ducks
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Avian bornaviruses (ABV) are a recently described group of intranuclear negative-stranded RNA viruses (Order Mononegavirales, Family Bornaviridae). At least 13 different ABV genotypes have been described. One genotype, the Canada goose genotype (ABV-CG), has been isolated from geese and swans and is widely distributed across North America. RESULTS: We have isolated and characterized a previously undescribed genotype of avian bornavirus from the brains of wild ducks. This new genotype, provisionally designated ABV genotype MALL, was detected in 12 of 83 mallards, and 1 of 8 wood ducks collected at a single location in central Oklahoma. The virus was cultured on primary duck embryo fibroblasts, fragments were cloned, and its genome sequence of 8904 nucleotides determined. This new genotype has 72% nucleotide identity and 83% amino acid identity with the ABV-CG genotype previously shown to be present in geese and swans. Histologic and immunohistochemical examination of the brains and eyes of four positive ducks indicated the presence of virus-infected neurons and glia in their cerebrums and retinas in the absence of inflammation. CONCLUSIONS: More than one genotype of ABV is circulating in North American waterfowl. While the infected ducks were not observed to be suffering from overt disease, based on the immunohistochemistry, we speculate that they may have suffered some visual impairment.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».