Linking the patterns of change in composition and function in bacterioplankton successions along environmental gradients
Notice bibliographique
Résumé
The connections that exist between the composition of bacterial communities and their functional attributes are still a matter of intense debate, despite over a decade of intense studies. Here we explored three different facets of the links that may exist between bacterioplankton compositional and functional successions that occurred along the water flow path in a complex watershed in southern Quebec. We analyzed the correlation between composition and function in terms of their absolute patterns, and in terms of their rates of change relative to transit time in environmental transitions, and relative to shifts in resources along the same transitions. Our results showed that the absolute patterns in bacterial community composition (BCC, using DGGE [denaturing gradient gel electrophoresis] profiles) and functional capacities (FC, using BIOLOG profiles) were not correlated, but that the rates of change in BCC and FC along the transitions were strongly correlated to each other. Further, we observed that the strength and shape of the relationship between the changes in BCC and FC varied relative to the type and intensity of gradient considered. Collectively, these results showed that BCC and FC are strongly related but in a very dynamic manner, such that their absolute patterns do not appear to be connected. This in turn suggests a high level of functional redundancy that occurs both within the existing community and in the meta-community from which phylotypes are selected to occupy the new niches that are created along the transitions.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».