MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2106695857 · doi:10.1177/104063871102300122

Frequency of the Allelic Variant of the <i>PTPLA</i> Gene Responsible for Centronuclear Myopathy in Labrador Retriever Dogs as Assessed in Italy

2011· article· en· W2106695857 sur OpenAlexaboutno aff
Fabio Gentilini, Elisa Zambon, Gualtiero Gandini, Marco Rosati, Alessandro Spadari, Noemi Romagnoli, María Elena Turba, Floriana Gernone

Notice bibliographique

RevueJournal of Veterinary Diagnostic Investigation · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolism, Diabetes, and Cancer
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenotypeAllele frequencyAlleleLabrador RetrieverMyopathyGenotype frequencyBiologyExonPopulationGeneticsPathologyMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Centronuclear myopathy (CNM) is an autosomal recessive hereditary disease affecting Labrador Retriever dogs. The disease is characterized by muscle lesions, typically encompassing reduction in the number and atrophy of type II fibers, and is caused by a short interspersed repeat element insertion in exon 2 of the protein tyrosine phosphatase-like member A. The actual allele frequency is unknown; a study was undertaken to ascertain it using a convenience-sample population composed of 217 Labrador Retrievers. In addition to 3 subjects already diagnosed with CNM, used as positive controls for polymerase chain reaction, only 2 unrelated dogs were heterozygous wild-type/mutation (wild-type/mut). Thus, the frequency of the CNM allele observed in the present study was 1.8% and 0.47% when including and excluding the 3 mut/mut homozygous cases, respectively. Based on the Hardy-Weinberg exact test (P = 1.00), the genotype frequency without the CNM-affected dogs was in agreement with the Hardy-Weinberg equilibrium. Assuming the Hardy-Weinberg equilibrium law, the expected frequency of the homozygous mutated genotype was calculated to be approximately 0.00005, which corresponds to 1 case of CNM out of 20,000 dogs. In conclusion, the present study indicates that the CNM allele is present but rare in a convenience sample of Labrador Retrievers in Italy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,336
Score d'incertitude au seuil0,305

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Veterinary Diagnostic InvestigationMême sujetMetabolism, Diabetes, and CancerTravaux en français237 207