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Enregistrement W2106702513 · doi:10.1128/jb.01536-07

Modulation of Hexa-Acyl Pyrophosphate Lipid A Population under<i>Escherichia coli</i>Phosphate (Pho) Regulon Activation

2008· article· en· W2106702513 sur OpenAlexaff
Martin G. Lamarche, Sang‐Hyun Kim, Sébastien Crépin, Michaël Mourez, Nicolas Bertrand, Russell E. Bishop, J. Daniel Dubreuil, Josée Harel

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Genetics and Biotechnology
Établissements canadiensMcMaster UniversityUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRegulonBiologyLipid AEscherichia coliMutantBiochemistryVirulenceMicrobiologyBacterial outer membraneGeneBacteriaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Environmental phosphate is an important signal for microorganism gene regulation, and it has recently been shown to trigger some key bacterial virulence mechanisms. In many bacteria, the Pho regulon is the major circuit involved in adaptation to phosphate limitation. The Pho regulon is controlled jointly by the two-component regulatory system PhoR/PhoB and by the phosphate-specific transport (Pst) system, which both belong to the Pho regulon. We showed that a pst mutation results in virulence attenuation in extraintestinal pathogenic Escherichia coli (ExPEC) strains. Our results indicate that the bacterial cell surface of the pst mutants is altered. In this study, we show that pst mutants of ExPEC strains display an increased sensitivity to different cationic antimicrobial peptides and vancomycin. Remarkably, the hexa-acylated 1-pyrophosphate form of lipid A is significantly less abundant in pst mutants. Among differentially expressed genes in the pst mutant, lpxT coding for an enzyme that transfers a phosphoryl group to lipid A, forming the 1-diphosphate species, was found to be downregulated. Our results strongly suggest that the Pho regulon is involved in lipid A modifications, which could contribute to bacterial surface perturbations. Since the Pho regulon and the Pst system are conserved in many bacteria, such a lipid A modification mechanism could be widely distributed among gram-negative bacterial species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,334
Score d'incertitude au seuil0,724

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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