Parsimony Analysis of East Coast Salt Marsh Plant Distributions
Notice bibliographique
Résumé
A parsimony algorithm was used to evaluate the distribution and co-occurrence of 46 vascular salt marsh-associated species in 20 coastal salt marshes from Biscayne Bay National Park, FL, to Sable Island Marine Protected Sanctuary, NS, Canada. The method considers each salt marsh as if it were a taxon, and the presence or absence of a particular vascular plant species as a “character state” of that taxon. Using this information, a 20 × 46 data matrix was created and examined by multivariate ordination techniques and by parsimony analysis using the program WinClada running over NONA. A hierarchical clustering showed that the salt marsh sites on the eastern seaboard of North America formed two main clusters, one including all of the Florida sites and South Carolina, and the second including all of the more northern sites: North Carolina, Virginia, New Jersey, New York, and Sable Island, NS, Canada. Within the large southern cluster, we find two major sub-clusters separating the Florida marshes from those of South Carolina. Likewise, within the large northern cluster, we find two major sub-clusters separating North Carolina and Virginia from the other northern marshes. An essentially similar pattern of site grouping was also observed using the ordination technique of non-metric multidimensional scaling, in which the southern marshes all aligned to the left of the origin, while the more northern marshes align to its right. Parsimony analysis yielded twelve equally parsimonious trees from which a strict consensus tree was constructed. The topology of the consensus tree clearly shows two major clades, a southern one and a northern one, with the division occurring between South and North Carolina. The main southern clade is supported by the presence of Sporobolus virginicus (Seashore Dropseed), while the main northern clade is supported by the presence of Ruppia maritima (Widgeongrass). Spartina alterniflora (Smooth or Atlantic Cordgrass), which we take as the single species that defines the salt marsh on the eastern coast of North America, was present in all of the sampled sites except Biscayne Bay National Park, FL, a mangrove swamp.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,011 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».