Influence of <i>cis</i> double-bond parametrization on lipid membrane properties: How seemingly insignificant details in force-field change even qualitative trends
Notice bibliographique
Résumé
We have employed atomistic molecular dynamics simulations to investigate the effect of double-bond parametrization on lipid membrane properties. As models, we use one-component membranes composed of glycerol-based phosphatidylcholines (PCs) with monounsaturated acyl chains, and we complement these studies by additional PC/cholesterol simulations. We compare differences between double-bond parametrizations by varying the position of the double bond systematically along the lipid hydrocarbon chains. The results give rise for concern: They indicate that the double-bond description may change not only the quantitative but also the qualitative nature of membrane behavior. In particular, we find that the double-bond description which accounts for skew states in the vicinity of a double bond predicts a maximum in membrane disorder, when the double bond resides at the middle of an acyl chain, in agreement with experiments. The more commonly used description which does not accommodate skew states, however, predicts membrane disorder to decrease monotonically as the double bond is shifted from the glycerol backbone to the end of an acyl chain. The results highlight the importance of properly describing double bonds especially in many-component membranes, where the interplay of different molecule types is difficult to predict on intuitive grounds.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».