Vacuolar Protein Sorting Genes Regulate Mat Formation in Saccharomyces cerevisiae by Flo11p-Dependent and -Independent Mechanisms
Notice bibliographique
Résumé
Saccharomyces cerevisiae generates complex biofilms called mats on low-density (0.3%) agar plates. The mats can be morphologically divided into two regions: (i) hub, the interior region characterized by the presence of wrinkles and channels, and (ii) rim, the smooth periphery. Formation of mats depends on the adhesin Flo11p, which is also required for invasive growth, a phenotype in which the S. cerevisiae yeasts grow as chains of cells that dig into standard-density (2%) agar plates. Although both invasive growth and mat formation depend on Flo11p, mutations that perturb the multivesicular body (MVB) protein sorting pathway inhibit mat formation in a FLO11-independent manner. These mutants, represented by vps27Δ, disrupt mat formation but do not affect invasive growth, FLO11 gene or protein expression, or Flo11p localization. In contrast, an overlapping subset of MVB mutants (represented by ESCRT [endosomal sorting complex required for transport] complex genes such as VPS25) interrupt the Rim101p signal transduction cascade, which is required for FLO11 expression, and thus block both invasive growth and mat formation. In addition, this report shows that mature Flo11p is covalently associated with the cell wall and shed into the extracellular matrix of the growing mat.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».