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Enregistrement W2106960759 · doi:10.1158/1078-0432.ccr-14-0289

Validation of Biomarkers That Complement CA19.9 in Detecting Early Pancreatic Cancer

2014· article· en· W2106960759 sur OpenAlexaff
Alison Chan, Ioannis Prassas, Apostolos Dimitromanolakis, Randall E. Brand, Stefano Serra, Eleftherios P. Diamandis, Ivan M. Blasutig

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic and Hepatic Oncology Research
Établissements canadiensUniversity Health NetworkUniversity of TorontoMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteUniversity of PittsburghAbbott Laboratories
Mots-clésBiomarkerPancreatic cancerMedicineStage (stratigraphy)CancerCA19-9Internal medicineBiomarker discoveryOncologyPopulationImmunoassayPathologyGastroenterologyImmunologyBiologyProteomicsAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is a significant cause of cancer mortality. Carbohydrate antigen 19.9 (CA19.9), the only tumor marker available to detect and monitor PDAC, is not sufficiently sensitive and specific to consistently differentiate early cancer from benign disease. In this study, we aimed to validate recently discovered serum protein biomarkers for the early detection of PDAC and ultimately develop a biomarker panel that could discriminate PDAC from other benign disease better than the existing marker CA19.9. PATIENTS AND METHODS: We performed a retrospective blinded evaluation of 400 serum samples collected from individuals recruited on a consecutive basis. The sample population consisted of 250 individuals with PDAC at various stages, 130 individuals with benign conditions and 20 healthy individuals. The serum levels of each biomarker were determined by ELISAs or automated immunoassay. RESULTS: By randomly splitting matched samples into a training (n = 186) and validation (n = 214) set, we were able to develop and validate a biomarker panel consisting of CA19.9, CA125, and LAMC2 that significantly improved the performance of CA19.9 alone. Improved discrimination was observed in the validation set between all PDAC and benign conditions (AUCCA19.9 = 0.80 vs. AUCCA19.9+CA125+LAMC2 = 0.87; P < 0.005) as well as between early-stage PDAC and benign conditions (AUCCA19.9 = 0.69 vs. AUCCA19.9+CA125+LAMC2 = 0.76; P < 0.05) and between early-stage PDAC and chronic pancreatitis (CP; AUCCA19.9 = 0.59 vs. AUCCA19.9+CA125+LAMC2 = 0.74; P < 0.05). CONCLUSIONS: The data demonstrate that a serum protein biomarker panel consisting of CA125, CA19.9, and LAMC2 is able to significantly improve upon the performance of CA19.9 alone in detecting PDAC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,010
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,037
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0100,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,388
Tête enseignante GPT0,576
Écart entre enseignants0,188 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations154
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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