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Enregistrement W2106985617 · doi:10.5539/ijb.v5n1p25

The Sensitivity of PCR to the Number of Lactococcus garvieae in Different Concentrations of NaCl: FTA Technique

2012· article· en· W2106985617 sur OpenAlexvenueno aff
Nizar Issa Alrabadi

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Biology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIdentification and Quantification in Food
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDNA extractiongenomic DNADNAMicrobiologyExtraction (chemistry)IncubationPolymerase chain reactionFood scienceBiologyReal-time polymerase chain reactionLactococcusChemistryBacteriaVeterinary medicineChromatographyBiochemistryLactococcus lactisGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The major objective of this study is to investigate the sensitivity of PCR to the number of Lactococcus garvieae (L. garvieae) in sterilized milk containing different concentrations of NaCl using FTA technique for genomic DNA extraction. This technique is a simple, rapid, precise and highly sensitive even to low count of bacterial cells in samples. The study used M17 medium to determine the number of bacterial cells, thereafter, FTA method was used for genomic DNA extraction. The results using M17 medium, indicated that the L. garvieae increased in all concentrations of NaCl during an incubation period of 24 hours, on the other hand, pH value decreased. However, the increase in bacterial count was statistically significant only on 0, 2% and 4% of NaCl concentrations. In conjunction with this, the PCR showed sensitivity to both low and high numbers of bacterial cells in the samples. Increasing bacterial numbers led to an increase in the amount of DNA extracted via FTA cards and therefore, the intensity and clarity of bands of PCR reaction was also increased. This is the first study that uses FTA technique for DNA extraction in dairy products. Using FTA cards and subjecting to PCR in quantifying the bacterial growth is a very important issue because of its direct application in the field of milk, agricultural and animal products research and development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,060
Score d'incertitude au seuil0,133

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,336
Écart entre enseignants0,315 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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