Multiple<i>cis</i>Regulatory Elements Control RANTES Promoter Activity in Alveolar Epithelial Cells Infected with Respiratory Syncytial Virus
Notice bibliographique
Résumé
Respiratory syncytial virus (RSV) produces intense pulmonary inflammation, in part through its ability to induce chemokine synthesis in infected airway epithelial cells. RANTES (regulated upon activation, normally T-cell expressed and presumably secreted) is a CC chemokine which recruits and activates monocytes, lymphocytes, and eosinophils, all cell types present in the lung inflammatory infiltrate induced by RSV infection. In this study, we analyzed the mechanism of RSV-induced RANTES promoter activation in human type II alveolar epithelial cells (A549 cells). Promoter deletion and mutagenesis experiments indicate that RSV requires the presence of five different cis regulatory elements, located in the promoter fragment spanning from -220 to +55 nucleotides, corresponding to NF-kappaB, C/EBP, Jun/CREB/ATF, and interferon regulatory factor (IRF) binding sites. Although site mutations of the NF-kappaB, C/EBP, and CREB/AP-1 like sites reduce RSV-induced RANTES gene transcription to 50% or less, only mutations affecting IRF binding completely abolish RANTES inducibility. Supershift and microaffinity isolation assays were used to identify the different transcription factor family members whose DNA binding activity was RSV inducible. Expression of dominant negative mutants of these transcription factors further established their central role in virus-induced RANTES promoter activation. Our finding that the presence of multiple cis regulatory elements is required for full activation of the RANTES promoter in RSV-infected alveolar epithelial cells supports the enhanceosome model for RANTES gene transcription, which is absolutely dependent on binding of IRF transcription factors. The identification of regulatory mechanisms of RANTES gene expression is fundamental for rational design of inhibitors of RSV-induced lung inflammation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».