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Enregistrement W2107125519 · doi:10.1128/jcm.02332-07

Performance of HerpeSelect and Kalon Assays in Detection of Antibodies to Herpes Simplex Virus Type 2

2008· article· en· W2107125519 sur OpenAlexafffund
Jérôme LeGoff, Philippe Mayaud, Gérard Grésenguet, Helen A. Weiss, Nzambi Khonde, Éric Frost, Jacques Pépin, Laurent Bélec

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Microbiology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHerpesvirus Infections and Treatments
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesUniversité de SherbrookeInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleLondon School of Hygiene and Tropical MedicineStyrelsen för Internationellt Utvecklingssamarbete
Mots-clésSerologyHerpes simplex virusSeroconversionVirologySex organConcordanceAntibodyHerpes GenitalisGenital ulcerBiologyVirusImmunologyHerpesviridaeMedicineSexually transmitted diseaseViral diseaseGenital herpesHuman immunodeficiency virus (HIV)Internal medicineSyphilis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The performances of commercial enzyme-linked immunosorbent assays (ELISAs) in detecting herpes simplex virus type 2 (HSV-2) antibodies have been inconsistent for African and human immunodeficiency virus (HIV)-positive populations. We compared the performances of the HerpeSelect and Kalon glycoprotein G2 ELISAs for patients with genital ulcer disease in Ghana and the Central African Republic. Sera from 434 women were tested with the HerpeSelect assay, and a subsample (n = 199) was tested by the Kalon assay. Ulcer swabs and cervicovaginal lavage samples were tested for HSV-2 DNA by PCR. HSV-2-seronegative women with detectable genital HSV-2 DNA were retested for HSV-2 antibodies 14 and 28 days later by the two ELISAs. A total of 346 (80%) women were positive by HerpeSelect at baseline, and 225 (54%) had detectable genital (lesional or cervicovaginal) HSV-2 DNA. Sixty-six (19%) HerpeSelect-positive samples had low-positive index values (1.1 to 3.5), and 58% of these samples had detectable genital HSV-2 DNA. Global agreement between the two serological assays was 86%. Concordance was high (99%) for sera that were negative by HerpeSelect or had high index values (>3.5). Defining infection detected by HSV-2 DNA PCR and/or Kalon assay as true infection, 71% of sera with low-positive index values were associated with true HSV-2 infection. Twenty-five women were identified as having nonprimary first-episode genital HSV-2 infection. Rates of HSV-2 seroconversion at day 14 were 77% (10/13 patients) by HerpeSelect assay and 23% (3/13 patients) by Kalon assay, with four additional seroconversions detected by Kalon assay at day 28. HIV serostatus did not influence assay performance. Low index values obtained with the HerpeSelect assay may correspond to true HSV-2 infection, in particular to nonprimary first episodes of genital HSV-2 infection, and need to be interpreted in the context of clinical history.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,009
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,009
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,057
Tête enseignante GPT0,378
Écart entre enseignants0,321 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations42
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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