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Enregistrement W2107128330 · doi:10.1111/j.1558-5646.2007.00178.x

CLINAL VARIATION IN MHC DIVERSITY WITH TEMPERATURE: EVIDENCE FOR THE ROLE OF HOST?PATHOGEN INTERACTION ON LOCAL ADAPTATION IN ATLANTIC SALMON

2007· article· en· W2107128330 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueEvolution · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEvolution and Genetic Dynamics
Établissements canadiensMinistère des Ressources naturelles et des Forêts (Québec)Fisheries and Oceans CanadaUniversité Laval
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyPathogenMajor histocompatibility complexAdaptation (eye)GeneticsHost (biology)Local adaptationVirulenceGenetic diversityAlleleSpecies richnessEcologyEvolutionary biologyImmune systemGenePopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In vertebrates, variability at genes of the Major Histocompatibility Complex (MHC) represents an important adaptation for pathogen resistance, whereby high allelic diversity confers resistance to a greater number of pathogens. Pathogens can maintain diversifying selection pressure on their host's immune system that can vary in intensity based on pathogen richness, pathogen virulence, and length of the cohabitation period, which tend to increase with temperature. In this study, we tested the hypothesis that genetic diversity of MHC increases with temperature along a latitudinal gradient in response to pathogen selective pressure in the wild. A total of 1549 Atlantic salmon from 34 rivers were sampled between 46 degrees N and 58 degrees N in Eastern Canada. The results supported our working hypothesis. In contrast to the overall pattern observed at microsatellites, MHC class II allelic diversity increased with temperature, thus creating a latitudinal gradient. The observed temperature gradient was more pronounced for MHC amino acids of the peptide-binding region (PBR), a region that specifically binds to pathogens, than for the non-PBR. For the subset of rivers analyzed for bacterial diversity, MHC amino acid diversity of the PBR also increased significantly with bacterial diversity in each river. A comparison of the relative influence of temperature and bacterial diversity revealed that the latter could have a predominant role on MHC PBR variability. However, temperature was also identified as an important selective agent maintaining MHC diversity in the wild. Based on the bacteria results and given the putative role of temperature in shaping large-scale patterns of pathogen diversity and virulence, bacterial diversity is a plausible selection mechanism explaining the observed association between temperature and MHC variability. Therefore, we propose that genetic diversity at MHC class II represents local adaptation to cope with pathogen diversity in rivers associated with different thermal regimes. This study illuminates the link between selection pressure from the environment, host immune adaptation, and the large-scale genetic population structure for a nonmodel vertebrate in the wild.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,694
Score d'incertitude au seuil0,363

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle