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EVALUATION OF COMMERCIAL ASSAYS FOR DETECTING WEST NILE VIRUS ANTIGEN

2006· article· en· W2107171401 sur OpenAlexaffabout
Kristen L. Burkhalter, L. Robbin Lindsay, Robert Anderson, Antonia Dibernardo, Whalley K. Fong, Roger S. Nasci

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Mosquito Control Association · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMosquito-borne diseases and control
Établissements canadiensResponse Biomedical (Canada)University of WinnipegPublic Health Agency of Canada
Organismes subventionnairesPublic Health Agency
Mots-clésVirologyBiologyWest Nile virusFlavivirusVirusFlaviviridaeArbovirusEncephalitisAntigenReverse transcriptasePolymerase chain reactionViral diseaseImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Two commercially available West Nile virus (WNV) detection assays (RAMP WNV test, Response Biomedical Corp., Burnaby, British Columbia, Canada; and VecTest WNV antigen assay, Medical Analysis Systems, Inc., Camarillo, CA) were compared for sensitivity, specificity, and ability to detect WNV in field-collected mosquito pools. Serially diluted stock seed WNV and St. Louis encephalitis virus (SLEV) were used to determine sensitivity and specificity. The RAMP WNV test detected WNV at concentrations as low as 3.17 log10 plaque-forming units per milliliter (PFU/ml), whereas the VecTest assay detected WNV at concentrations as low as 5.17 log10 PFU/ml. Neither test cross-reacted with SLEV. A WNV-specific reverse transcriptase polymerase chain reaction was used to identify positives among field-collected mosquito pools. The RAMP WNV test detected 94% of positive pools and the VecTest assay detected 65% of the positive field-collected pools. Despite these differences, both assays have characteristics that make them useful in WNV surveillance programs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,011
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,012
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,056

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0110,012
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0030,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,296
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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