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Enregistrement W2107237201 · doi:10.1002/9780470015902.a0000595.pub3

Developmentally Programmed <scp>DNA</scp> Rearrangements

2018· other· en· W2107237201 sur OpenAlexaff
Alejandro Saettone, Syed Nabeel‐Shah, Jeffrey Fillingham

Notice bibliographique

RevueEncyclopedia of Life Sciences · 2018
Typeother
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtist diversity and phylogeny
Établissements canadiensToronto Metropolitan University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyTetrahymenaChromatinCiliateDNAGeneMacronucleusGeneticsGenomeCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Developmentally programmed deoxyribonucleic acid (DNA) rearrangements are structural reorganisations of the genome that occur reproducibly during the development of a variety of organisms. In the majority of cases, programmed DNA rearrangements function to alter gene expression. V(D)J recombination is a DNA rearrangement that occurs during the development of the human immune system to assemble functional genes encoding antibodies. Some human pathogens use programmed DNA rearrangements to evade the immune system by varying the expression of their antigenic surface proteins. However, in some cases, the function of large‐scale developmentally programmed DNA rearrangements remains unknown. In the ciliate protozoan Tetrahymena thermophila , a wide variety of programmed rearrangements occur during the development of the somatic nucleus including chromosome fragmentation and deletion of specific DNA sequences. In a related ciliate Oxytricha trifallax , programmed genome rearrangements are needed to unscramble segments to assemble functional genes. Key Concepts Programmed DNA rearrangements utilise diverse recombination mechanisms. Human pathogens use programmed DNA rearrangements to vary expression of antigenic surface proteins to avoid the host immune system. V(D)J recombination in human development assembles functional genes encoding antibodies. Chromatin diminution in parasitic nematodes silences germ‐line‐specific gene expression in somatic cells. The ciliate protozoa undergo large‐scale programmed DNA rearrangements during nuclear development. The mechanism of programmed DNA deletion in the ciliate Tetrahymena thermophila involves small noncoding RNAs that direct formation of a specific chromatin structure. The ciliate Oxytricha trifallax unscrambles gene segments during the development of its somatic nucleus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,022

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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