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Enregistrement W2107412205 · doi:10.1038/ctg.2013.17

Higher Activity of the Inducible Nitric Oxide Synthase Contributes to Very Early Onset Inflammatory Bowel Disease

2014· article· en· W2107412205 sur OpenAlexafffund
Lucas A. Mastropaolo, Ryan Murchie, Christopher Griffiths, Cornelia Thöni, Abdul Elkadri, Wei Xu, A.H. Mack, Thomas D. Walters, Conghui Guo, David R. Mack, Hien Q. Huynh, Shairaz Baksh, Mark S. Silverberg, John H. Brumell, Scott B. Snapper, Aleixo M. Muise

Notice bibliographique

RevueClinical and Translational Gastroenterology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNitric Oxide and Endothelin Effects
Établissements canadiensMount Sinai HospitalChildren's Hospital of Eastern OntarioPrincess Margaret Cancer CentreStollery Children's HospitalHospital for Sick ChildrenSickKids FoundationUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesHospital for Sick Children
Mots-clésMedicineInflammatory bowel diseaseOdds ratioUlcerative colitisSingle-nucleotide polymorphismInternal medicineGastroenterologyATG16L1Crohn's diseaseImmunologyDiseaseGenotypeBiologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: The NOS2 gene encodes for the inducible nitric oxide synthase (iNOS), responsible for nitric oxide (NO) production, which contributes to antimicrobial and antipathogenic activities. Higher levels of both iNOS and NO-induced damage have been observed in inflammatory bowel disease (IBD) patients. NOS2 may have a role in a specific subset of IBD patients with severe and/or extensive colitis. Therefore, the aim of this study is to examine the role of NOS2 in such a subset, very early onset IBD (VEO-IBD). METHODS: Seventeen tag single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the NOS2 gene were successfully genotyped in VEO-IBD patients. Genetic associations were replicated in an independent VEO-IBD cohort. Functional analysis for iNOS activity was performed on the most significantly associated functional variant. RESULTS: The NOS2 rs2297518 SNP was found to be associated in VEO-IBD in two independent cohorts. Upon combined analysis, a coding variant (S608L) showed the strongest association with VEO-IBD (Pcombined=1.13 × 10(-6), OR (odds ratio)=3.398 (95% CI (confidence interval) 2.02-5.717)) as well as associations with VEO-Crohn's disease and VEO-ulcerative colitis (UC). This variant also showed an association with UC diagnosed between 11 and 17 years of age but not with adult-onset IBD (>17 years). B-cell lymphoblastoid cell lines genotyped for the risk variant as well as Henle-407 cells transfected with a plasmid construct with the risk variant showed higher NO production. Colonic biopsies of VEO-IBD patients showed higher immunohistochemical staining of nitrotyrosine, indicating more nitrosative stress and tissue damage. CONCLUSIONS: These studies suggest the importance of iNOS in genetic susceptibility to younger IBD presentation due to higher NO production.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,331

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations90
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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