The Epstein-Barr Virus (EBV) Deubiquitinating Enzyme BPLF1 Reduces EBV Ribonucleotide Reductase Activity
Notice bibliographique
Résumé
A newly discovered virally encoded deubiquitinating enzyme (DUB) is strictly conserved across the Herpesviridae. Epstein-Barr virus (EBV) BPLF1 encodes a tegument protein (3,149 amino acids) that exhibits deubiquitinating (DUB) activity that is lost upon mutation of the active-site cysteine. However, targets for the herpesviral DUBs have remained elusive. To investigate a predicted interaction between EBV BPLF1 and EBV ribonucleotide reductase (RR), a functional clone of the first 246 N-terminal amino acids of BPLF1 (BPLF1 1-246) was constructed. Immunoprecipitation verified an interaction between the small subunit of the viral RR2 and BPLF1 proteins. In addition, the large subunit (RR1) of the RR appeared to be ubiquitinated both in vivo and in vitro; however, ubiquitinated forms of the small subunit, RR2, were not detected. Ubiquitination of RR1 requires the expression of both subunits of the RR complex. Furthermore, coexpression of RR1 and RR2 with BPLF1 1-246 abolishes ubiquitination of RR1. EBV RR1, RR2, and BPLF1 1-246 colocalized to the cytoplasm in HEK 293T cells. Finally, expression of enzymatically active BPLF1 1-246 decreased RR activity, whereas a nonfunctional active-site mutant (BPLF1 C61S) had no effect. These results indicate that the EBV deubiquitinating enzyme interacts with, deubiquitinates, and influences the activity of the EBV RR. This is the first verified protein target of the EBV deubiquitinating enzyme.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».