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Enregistrement W2107594265 · doi:10.1111/j.1472-765x.2008.02531.x

Mg<sup>2+</sup>-free buffer elevates transformation efficiency of<i>Vibrio parahaemolyticus</i>by electroporation

2009· article· en· W2107594265 sur OpenAlexaff
H. Wang, Mansel W. Griffiths

Notice bibliographique

RevueLetters in Applied Microbiology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensUniversity of GuelphCanadian Institute for Public Safety Research and Treatment
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésElectroporationVibrio parahaemolyticusTransformation efficiencyNucleaseTransformation (genetics)ExtracellularBiologySucroseMicrobiologyVibrioPlasmidDNAChemistryBacteriaBiochemistryGeneAgrobacteriumGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIMS: The ability to transform Vibrio spp. is limited by the extracellular nuclease that their cells secrete. The reported transformation efficiency of this organism is 10(2)-10(5) transformants per microgram DNA. We tried different buffers and conditions, aiming to elevate its transformation efficiency. METHODS AND RESULTS: MgCl(2) and sucrose are often included in the washing and/or electroporation buffers to stabilize the cell membrane. However, Mg(2+) is required for production and activity of the extracellular nuclease. A simple electroporation buffer lacking Mg(2+) was found to increase transformation efficiency dramatically, to levels 50-fold more than the buffers containing Mg(2+). To maintain the stability of the cell membranes, Mg(2+) was replaced with high concentrations of sucrose, from 272 to 408 mmol l(-1). With the new buffers, the transformation efficiency of Vibrio parahaemolyticus was increased to 2.2 x 10(6) transformants per microgram DNA. CONCLUSIONS: Mg(2+) in the buffer adversely affected transformation of V. parahaemolyticus by electroporation. The cell membranes of vibrio can be stabilized by high concentration of sucrose when Mg(2+) is absent. SIGNIFICANCE AND IMPACT OF THE STUDY: A greater transformation efficiency can facilitate the genetic analysis of an organism and its pathogenicity. Buffers lacking Mg(2+) can be used for other nuclease-producing organisms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,071
Score d'incertitude au seuil0,772

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,002
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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