Mg<sup>2+</sup>-free buffer elevates transformation efficiency of<i>Vibrio parahaemolyticus</i>by electroporation
Notice bibliographique
Résumé
AIMS: The ability to transform Vibrio spp. is limited by the extracellular nuclease that their cells secrete. The reported transformation efficiency of this organism is 10(2)-10(5) transformants per microgram DNA. We tried different buffers and conditions, aiming to elevate its transformation efficiency. METHODS AND RESULTS: MgCl(2) and sucrose are often included in the washing and/or electroporation buffers to stabilize the cell membrane. However, Mg(2+) is required for production and activity of the extracellular nuclease. A simple electroporation buffer lacking Mg(2+) was found to increase transformation efficiency dramatically, to levels 50-fold more than the buffers containing Mg(2+). To maintain the stability of the cell membranes, Mg(2+) was replaced with high concentrations of sucrose, from 272 to 408 mmol l(-1). With the new buffers, the transformation efficiency of Vibrio parahaemolyticus was increased to 2.2 x 10(6) transformants per microgram DNA. CONCLUSIONS: Mg(2+) in the buffer adversely affected transformation of V. parahaemolyticus by electroporation. The cell membranes of vibrio can be stabilized by high concentration of sucrose when Mg(2+) is absent. SIGNIFICANCE AND IMPACT OF THE STUDY: A greater transformation efficiency can facilitate the genetic analysis of an organism and its pathogenicity. Buffers lacking Mg(2+) can be used for other nuclease-producing organisms.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».