MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2107620449 · doi:10.1091/mbc.e02-06-0348

Synthetic Lethal Analysis Implicates Ste20p, a p21-activated Protein Kinase, in Polarisome Activation

2003· article· en· W2107620449 sur OpenAlexaff
April Goehring, David A. Mitchell, Amy H.Y. Tong, Megan Keniry, Charles Boone, G. F. Sprague

Notice bibliographique

RevueMolecular Biology of the Cell · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFungal and yeast genetics research
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical Sciences
Mots-clésBiologyCytokinesisCell biologyMitosisPhosphorylationMutantKinaseSeptinCyclin-dependent kinase 1GeneCell divisionCell polarityProtein phosphorylationCell Cycle ProteinFunction (biology)GeneticsProtein kinase ACell cycleCell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The p21-activated kinases Ste20p and Cla4p carry out undefined functions that are essential for viability during budding in Saccharomyces cerevisiae. To gain insight into the roles of Ste20p, we have used a synthetic lethal mutant screen to identify additional genes that are required in the absence of Cla4p. Altogether, we identified 65 genes, including genes with roles in cell polarity, mitosis, and cell wall maintenance. Herein, we focus on a set that defines a function carried out by Bni1p and several of its interacting proteins. We found that Bni1p and a group of proteins that complex with Bni1p (Bud6p, Spa2p, and Pea2p) are essential in a cla4delta mutant background. Bni1p, Bud6p, Spa2, and Pea2p are members of a group of polarity determining proteins referred to as the polarisome. Loss of polarisome proteins from a cla4delta strain causes cells to form elongated buds that have mislocalized septin rings. In contrast, other proteins that interact with or functionally associate with Bni1p and have roles in nuclear migration and cytokinesis, including Num1p and Hof1p, are not essential in the absence of Cla4p. Finally, we have found that Bni1p is phosphorylated in vivo, and a substantial portion of this phosphorylation is dependent on STE20. Together, these results suggest that one function of Ste20p may be to activate the polarisome complex by phosphorylation of Bni1p.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,533

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations99
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMolecular Biology of the CellMême sujetFungal and yeast genetics researchTravaux en français237 207