Metabolic changes in plasma from the umbilical cord of small for gestational age babies and from a rat model of placental insufficiency
Notice bibliographique
Résumé
Small for gestational age (SGA) can have lifelong consequences. Placental dysfunction is implicated in its pathophysiology. A reduced uterine perfusion pressure (RUPP) rat model can create an in vivo model of placental insufficiency. Metabolomics is the holistic study of the basic biochemistry within a biological system. The authors aimed to examine the metabolomic differences in (1) venous cord blood (VCB) plasma between SGA babies and normal controls and (2) plasma from the RUPP rat. Cord blood was collected from normally grown babies, and babies with confirmed SGA (n=7–8). Blood was also collected from RUPP, sham operated and control rats (n=7–9). All samples sets were analysed using Ultra Performance Liquid Chromatography/LTQ-Orbitrap Mass Spectrometry. In VCB, over 1700 metabolite features were detected, of which 900 (52%) showed significant difference between SGA and normally grown babies (p<0.05). Multivariate data analysis (Canonical Variates Analysis – CVA) showed that the metabolic profiles of normal and SGA samples were clearly different. Chemical identity of the metabolites will be elucidated fully but there was a preponderance of phospholipids and vitamin D derivatives. In rat plasma, there were 3825 metabolite features detected. 712 of these features had a p value <0.05. Multivariate data analysis showed that metabolite differences between normal and RUPP samples were highly correlated. Carnitine and phosphocholine metabolism were of notable interest. This study has shown metabolomic differences in VCB plasma between SGA babies and normal controls as well as in an animal model of placental insufficiency. Both studies may lead to a closer understanding of the aetiology of SGA.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».