Mutation in 23S rRNA Associated with Macrolide Resistance in <i>Neisseria gonorrhoeae</i>
Notice bibliographique
Résumé
Fifty-six azithromycin-resistant (MICs, 2.0 to 4.0 micro g/ml) Neisseria gonorrhoeae strains with cross-resistance to erythromycin (MICs, 2.0 to 64.0 micro g/ml), isolated in Canada between 1997 and 1999, were characterized, and their mechanisms of azithromycin resistance were determined. Most (58.9%) of them belonged to auxotype-serotype class NR/IB-03, with a 2.6-mDa plasmid. Based on resistance to crystal violet (MICs >or= 1 micro g/ml), 96.4% of these macrolide-resistant strains appeared to have increased efflux. Nine of the eleven strains selected for further characterization were found to have a promoter region mtrR mutation, a single-base-pair (A) deletion in the 13-bp inverted repeat, which is believed to cause overexpression of the mtrCDE-encoded efflux pump. The two remaining macrolide-resistant strains (erythromycin MIC, 64.0 micro g/ml; azithromycin MIC, 4.0 micro g/ml), which did not have the mutation in the mtrR promoter region, were found to have a C2611T mutation (Escherichia coli numbering) in the peptidyltransferase loop in domain V of the 23S rRNA alleles. Although mutations in domain V of 23S rRNA alleles had been reported in other bacteria, including E. coli, Streptococcus pneumoniae, and Helicobacter pylori, this is the first observation of these mutations associated with macrolide resistance in N. gonorrhoeae.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».