Expression analysis of histone acetyltransferases in rice under drought stress
Notice bibliographique
Résumé
Histone acetylation is one of the vital reversible modifications of chromatin structure that regulates gene expression in eukaryotes. Histone acetyltransferases (HATs) and histone deacetylases (HDACs) maintain the homeostasis of histone acetylation. Studies in Arabidopsis have revealed that HATs are involved in plant responses to various stresses including light, temperature, salt and ABA. Drought stress, a very common environmental stress, could cause a range of physiological and biochemical responses in plants involving HATs. Eight HATs in four different families (CBP, GNAT, MYST, and TAF(II)250 family) are known in rice. In this research, four OsHATs, one from each family, were chosen based on in silico domain and promoter analysis for their response under drought conditions. Drought stress was introduced to two-leaf-stage rice seedlings. The effectiveness of drought treatment was confirmed by the measurement of relative water content (RWC). Real-time quantitative polymerase chain reaction analysis demonstrated that drought stress caused a significant increase in the expression of four HATs (OsHAC703, OsHAG703, OsHAF701 and OsHAM701) in rice plants. Additionally, the Western-blot analysis showed that the acetylation level on certain lysine sites of H3 (lysine 9, lysine 18 and lysine 27) and H4 (lysine 5) increased with OsHATs expression. The significant increase in the transcript levels of OsHATs and the acetylation level of lysine residues on Histone H3 and H4 suggest that OsHATs are involved in drought stress responses in rice.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».