MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2107759266 · doi:10.1242/jcs.00927

Depolarization-induced translocation of the RNA-binding protein Sam68 to the dendrites of hippocampal neurons

2004· article· en· W2107759266 sur OpenAlexaff
Naïla Ben Fredj, Julien Grange, Rémy Sadoul, Stéphane Richard, Yves Goldberg, Véronique Boyer

Notice bibliographique

RevueJournal of Cell Science · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyDepolarizationCell biologyGreen fluorescent proteinNucleusFusion proteinHippocampal formationRNAMolecular biologyBiophysicsBiochemistryNeuroscienceGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The traffic and expression of mRNAs in neurons are modulated by changes in neuronal activity. The regulation of neuronal RNA-binding proteins is therefore currently receiving attention. Sam68 is a ubiquitous nuclear RNA-binding protein implicated in post-transcriptional processes such as signal-dependent splice site selection. We show that Sam68 undergoes activity-responsive translocation to the soma and dendrites of hippocampal neurons in primary culture. In unstimulated neurons transiently expressing a GFP-Sam68 fusion protein, 90% of the cells accumulated the protein exclusively in the nucleus, and 4% showed extension of GFP-Sam68 to the dendrites. This nuclear expression pattern required the integrity of the Sam68 N-terminus. When present, the dendritic GFP-Sam68 formed granules, 26% of which were colocalized with ethidium bromide-stained RNA clusters. Most of the GFP-Sam68 granules were completely stationary, but a few moved in either a retrograde or anterograde direction. Following depolarization by 25 mM KCl, 50% of neurons displayed dendritic GFP-Sam68. GFP-Sam68 invaded the dendrites after 2 hours with high KCl, and returned to the nucleus within 3 hours after termination of the KCl treatment. A control GFP fusion derived from the SC-35 splicing factor remained fully nuclear during depolarization. No significant change was observed in the phosphorylation of Sam68 after depolarization. Translocation of Sam68 to the distal dendrites was microtubule dependent. Blockade of calcium channels with nimodipine abolished the translocation. Furthermore, inhibition of CRM-1-mediated nuclear export by leptomycin B partially prevented the depolarization-induced nuclear efflux of GFP-Sam68. These results support the possible involvement of Sam68 in the activity-dependent regulation of dendritic mRNAs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,104

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Cell ScienceMême sujetRNA Research and SplicingTravaux en français237 207