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Enregistrement W2107928264 · doi:10.1186/cc11466

Prognostic utility and characterization of cell-free DNA in patients with severe sepsis

2012· article· en· W2107928264 sur OpenAlexafffundabout
Dhruva J. Dwivedi, Lisa J. Toltl, Laura L. Swystun, Janice Pogue, Kao‐Lee Liaw, Jeffrey I. Weitz, Alison Fox‐Robichaud, Patricia C. Liaw

Notice bibliographique

RevueCritical Care · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensSt. Joseph’s Healthcare HamiltonHamilton Health SciencesPopulation Health Research InstituteMcMaster UniversityThrombosis and Atherosclerosis Research Institute
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésMedicineSepsisCell-free fetal DNASevere sepsisIntensive care medicineInternal medicineBioinformaticsGeneticsSeptic shock

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Although sepsis is the leading cause of death in noncoronary critically ill patients, identification of patients at high risk of death remains a challenge. In this study, we examined the incremental usefulness of adding multiple biomarkers to clinical scoring systems for predicting intensive care unit (ICU) mortality in patients with severe sepsis. METHODS: This retrospective observational study used stored plasma samples obtained from 80 severe sepsis patients recruited at three tertiary hospital ICUs in Hamilton, Ontario, Canada. Clinical data and plasma samples were obtained at study inclusion for all 80 patients, and then daily for 1 week, and weekly thereafter for a subset of 50 patients. Plasma levels of cell-free DNA (cfDNA), interleukin 6 (IL-6), thrombin, and protein C were measured and compared with clinical characteristics, including the primary outcome of ICU mortality and morbidity measured with the Multiple Organ Dysfunction (MODS) score and Acute Physiology and Chronic Health Evaluation (APACHE) II scores. RESULTS: The level of cfDNA in plasma at study inclusion had better prognostic utility than did MODS or APACHE II scores, or the biomarkers measured. The area under the receiver operating characteristic (ROC) curves for cfDNA to predict ICU mortality is 0.97 (95% CI, 0.93 to 1.00) and to predict hospital mortality is 0.84 (95% CI, 0.75 to 0.94). We found that a cfDNA cutoff value of 2.35 ng/μl had a sensitivity of 87.9% and specificity of 93.5% for predicting ICU mortality. Sequential measurements of cfDNA suggested that ICU mortality may be predicted within 24 hours of study inclusion, and that the predictive power of cfDNA may be enhanced by combining it with protein C levels or MODS scores. DNA-sequence analyses and studies with Toll-like receptor 9 (TLR9) reporter cells suggests that the cfDNA from sepsis patients is host derived. CONCLUSIONS: These studies suggest that cfDNA provides high prognostic accuracy in patients with severe sepsis. The serial data suggest that the combination of cfDNA with protein C and MODS scores may yield even stronger predictive power. Incorporation of cfDNA in sepsis risk-stratification systems may be valuable for clinical decision making or for inclusion into sepsis trials.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations313
Publié2012
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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