Swine-origin influenza virus A(H1N1)v: lessons learnt from the early phase of the epidemic
Notice bibliographique
Résumé
In late March 2009, Mexican authorities identified an unexpected increase in the number of cases of influenza-like illness (ILI), including a higher than expected number of cases of severe pneumonia characterized by respiratory distress syndrome.1 At the beginning of April, a novel influenza virus A/(H1N1) variant (H1N1v) of apparent swine origin was identified by the US Centers for Disease Control and Prevention in two children in California.2 The same variant was then identified in Canada in biological samples from a Mexican patient with ILI. The evidence of sustained community transmission of H1N1v in different countries on more than one continent led the World Health Organization (WHO) to declare Phase 6 of pandemic alert (‘The Pandemic Phase’). H1N1v appears to have derived from a further reassortment of a triple reassortant North American swine virus with the NA and M segments of a European swine virus.3 However, when and where this variant emerged remain unknown, though phylogenetic analyses suggest that it had been circulating for a number of years before trans-species passage and adaptation to the human host.4 H1N1v is efficiently transmitted among humans, probably through the same modalities as seasonal influenza viruses, that is, through large droplets or contact with contaminated surfaces. Moreover, because the variant is novel, much of the population is susceptible, increasing the potential for spread. Since the time of the identification of H1N1v, several lessons have been learned, though there are also some gaps in …
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,011 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,003 |
| Communication savante | 0,003 | 0,007 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,004 | 0,008 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».