Expression of base excision, mismatch, and recombination repair genes in the organogenesis‐stage rat conceptus and effects of exposure to a genotoxic teratogen, 4‐hydroperoxycyclophosphamide
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: DNA repair capability may influence the outcome of genotoxic teratogen exposure. The goals of this study were to assess the expression of base excision repair (BER), mismatch repair (MMR), and recombination repair (RCR) genes in the mid-organogenesis rat conceptus and to determine the effects on expression of exposure to the genotoxic teratogen, 4-hydroperoxycyclophosphamide (4-OOHCPA). METHODS: The expression of 17 BER, MMR, and RCR genes was examined in gestational day (GD) 10-12 rat conceptuses using the antisense RNA (aRNA) technique. Embryos were cultured with 10 microM 4-OOHCPA to examine effects on gene expression. RESULTS: Yolk sacs and embryos had similar gene expression patterns for all three DNA repair pathways from GD10-12. Transcripts for APNG, PMS1, and RAD54 were present at high concentrations in both tissues. The remainder of the genes were expressed at low levels in yolk sac, with a few not detected on GD10 and 11. In the embryo, transcripts for most genes were low on GD10 and 11; several increased by GD12. After exposure to 4-OOHCPA for 24 hr, XRCC1 and RAD57 expression decreased in yolk sac, whereas only RAD51 transcripts decreased in the embryo. By 44 hr, transcripts for all BER genes decreased in yolk sac; in the embryo, most BER, MMR, and RCR genes decreased, many below the level of detection. CONCLUSIONS: The expression of DNA repair genes in the mid-organogenesis rat conceptus is varied and subject to down-regulation by 4-OOHCPA. DNA repair gene expression may determine the consequences of genotoxicant exposure during development.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».