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Enregistrement W2108088498 · doi:10.1139/w04-120

Colonization of <i>Phaseolus vulgaris</i> nodules by <i>Agrobacterium</i>-like strains

2005· article· en· W2108088498 sur OpenAlexvenueno aff
Ridha Mhamdi, Moncef Mrabet, Gisèle Laguerre, Ravi Tiwari, Mohamed Elarbi Aouani

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLegume Nitrogen Fixing Symbiosis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAgrobacteriumBiologyAgrobacterium tumefaciensRhizobiaceaePhaseolusRhizobiumTransformation (genetics)RhizobiaMicrobiologyBotanyGeneBacteriaGeneticsSymbiosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Non-nodulating Agrobacterium-like strains identified among root nodule isolates of common bean were labeled with gusA, a reporter gene encoding beta-glucuronidase (GUS). Bean plants were then co-inoculated with an infective Rhizobium strain and labeled transconjugants of Agrobacterium-like strains. Blue staining of nodules showed that Agrobacterium-like strains were able to colonize these symbiotic organs. Isolation and characterization by restriction fragment length polymorphism analysis of PCR-amplified 16S rRNA genes revealed a mixed population of Rhizobium and Agrobacterium-like strains in all nodules showing GUS activity. PCR amplification of the nifH gene and nodulation tests did not show any evidence of acquisition of symbiotic gene by lateral transfer from Rhizobium to Agrobacterium-like strains. Moreover, these strains were able to invade mature nodules. Based on sequencing of the 16S rRNA gene, one of these Agrobacterium-like strains showed 99.4% sequence similarity with Agrobacterium bv. 1 reference strains and 99% similarity with an Agrobacterium bv. 1 strain isolated from Acacia mollisima in Senegal. Agrobacterium tumefaciens C58 and the disarmed variant AT123 did not show any ability to colonize nodules. Co-inoculation of bean seeds with Agrobacterium and Rhizobium strains did not enhance nodulation and plant yield under controlled conditions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,448
Score d'incertitude au seuil0,966

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,181
Écart entre enseignants0,174 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations71
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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