Diagnostic Performance of the Roche AMPLICOR PCR in Detecting <i>Neisseria gonorrhoeae</i> in Genitourinary Specimens from Female Sex Workers in Cotonou, Benin
Notice bibliographique
Résumé
The objective of this study was to evaluate the diagnostic performance of the Roche multiplex AMPLICOR Chlamydia trachomatis/Neisseria gonorrhoeae PCR test for the detection of Neisseria gonorrhoeae infection in female urine specimens and wet and dry endocervical swabs. Endocervical swabs and urine specimens were collected from 342 female sex workers from Cotonou, Benin, and were tested using the AMPLICOR C. trachomatis/N. gonorrhoeae test (Roche Diagnostic Systems, Inc., Branchburg, N.J.) with internal control detection. Endocervical swabs were also cultured on Thayer-Martin medium. A series of alternate standards that included a combination of all the tests but not the test being evaluated was used to assess the performance of the test with each type of specimen. The sensitivity, specificity, and positive and negative predictive values for the urine were 53.8, 98.9, 93.5, and 87.5%, respectively. Corresponding figures for the wet swab were 91.5, 100, 100, and 97.4%, respectively. Those for the dry swab were 96.3, 96.2, 88.5, and 98.8%, respectively. Based on this study, the AMPLICOR PCR assay showed a low sensitivity for detection of N. gonorrhoeae infection in urine specimens, whereas the test was found to be highly sensitive and specific with endocervical specimens.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».