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Enregistrement W2108218086 · doi:10.1089/omi.2010.0092

COX-2-Dependent and COX-2-Independent Mode of Action of Celecoxib in Human Liver Cancer Cells

2011· article· en· W2108218086 sur OpenAlexaff
Melchiorre Cervello, Dimcho Bachvarov, Antonella Cusimano, Francesca Sardina, Antonina Azzolina, Nadia Lampiasi, Lydia Giannitrapani, James A. McCubrey, Giuseppe Montalto

Notice bibliographique

RevueOMICS A Journal of Integrative Biology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInflammatory mediators and NSAID effects
Établissements canadiensUniversité LavalHôtel-Dieu de QuébecCentre hospitalier universitaire de Québec
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCelecoxibMicroarray analysis techniquesCancer researchCell cultureMicroarrayBiological pathwayCancerGeneBiologyProgrammed cell deathCell growthGene expressionPharmacologyApoptosisBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Celecoxib (Celebrex((R)), Pfizer) is a selective cyclooxygenase-2 (COX-2) inhibitor with chemopreventive and antitumor effects. However, it is now well known that celecoxib has several COX-2-independent activities. To better understand COX-2-independent molecular mechanisms underlying the antitumor activity of celecoxib, we investigated the expression profile of the celecoxib-treated COX-2-positive (Huh7) and COX-2-negative (HepG2) liver cancer cell lines, using microarray analysis. Celecoxib treatment resulted in significantly altered expression levels of 240 and 403 transcripts in Huh7 and HepG2 cells, respectively. Confirmation of the microarray results was performed for selected genes by semiquantitative RT-PCR. A pathway/functional analysis of celecoxib-affected transcripts, using ingenuity pathway analysis and exploring biological association networks, revealed that celecoxib modulates expression of numerous genes involved in a variety of cellular processes, including cell death, cellular growth and proliferation, lipid metabolism, and energy turnover. Some of these processes were common for both HCC cell lines and seem to be coupled with NF-κB signaling, while others were cell-specific and possibly linked to the presence or the absence of COX-2 activity in the corresponding cell line. Many novel genes emerged from our analyses that were not previously reported to be affected by celecoxib. Further studies on selected celecoxib-responsive genes will establish if they may serve as potential molecular targets for more effective therapeutic strategies in HCC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,316
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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