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Enregistrement W2108231450 · doi:10.1093/nar/gkr371

Phosphorylation of Mcm2 modulates Mcm2–7 activity and affects the cell’s response to DNA damage

2011· article· en· W2108231450 sur OpenAlexafffund
Brent E. Stead, Christopher J. Brandl, Megan J. Davey

Notice bibliographique

RevueNucleic Acids Research · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesCanadian Cancer Society Research InstituteCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyHelicaseMethyl methanesulfonatePhosphorylationDNA damageDNA replicationDNAMolecular biologyCell biologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The S-phase kinase, DDK controls DNA replication through phosphorylation of the replicative helicase, Mcm2-7. We show that phosphorylation of Mcm2 at S164 and S170 is not essential for viability. However, the relevance of Mcm2 phosphorylation is demonstrated by the sensitivity of a strain containing alanine at these positions (mcm2(AA)) to methyl methanesulfonate (MMS) and caffeine. Consistent with a role for Mcm2 phosphorylation in response to DNA damage, the mcm2(AA) strain accumulates more RPA foci than wild type. An allele with the phosphomimetic mutations S164E and S170E (mcm2(EE)) suppresses the MMS and caffeine sensitivity caused by deficiencies in DDK function. In vitro, phosphorylation of Mcm2 or Mcm2(EE) reduces the helicase activity of Mcm2-7 while increasing DNA binding. The reduced helicase activity likely results from the increased DNA binding since relaxing DNA binding with salt restores helicase activity. The finding that the ATP site mutant mcm2(K549R) has higher DNA binding and less ATPase than mcm2(EE), but like mcm2(AA) results in drug sensitivity, supports a model whereby a specific range of Mcm2-7 activity is required in response to MMS and caffeine. We propose that phosphorylation of Mcm2 fine-tunes the activity of Mcm2-7, which in turn modulates DNA replication in response to DNA damage.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,300
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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