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Enregistrement W2108251992 · doi:10.1093/pcp/pcq063

Metabolic Diversification of Benzylisoquinoline Alkaloid Biosynthesis Through the Introduction of a Branch Pathway in Eschscholzia californica

2010· article· en· W2108251992 sur OpenAlexaff
Tomoya Takemura, Nobuhiro Ikezawa, Kinuko Iwasa, Fumihiko Sato

Notice bibliographique

RevuePlant and Cell Physiology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant tissue culture and regeneration
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBenzylisoquinolineBiosynthesisAlkaloidBiochemistryMetabolic pathwayMetaboliteChemistryBerberineEnzymeBiologyStereochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Higher plants produce a diverse array of secondary metabolites. These chemicals are synthesized from simple precursors through multistep reactions. To understand how plant cells developed such a complicated metabolism, we examined the plasticity of benzyl isoquinoline alkaloid biosynthesis in transgenic Eschscholzia californica cells with the ectopic expression of Coptis japonica scoulerine-9-O-methyltransferase (CjSMT). CjSMT catalyzes the O-methylation of scoulerine to produce tetrahydrocolumbamine (THC) in berberine biosynthesis and is not involved in benzophenanthridine alkaloid biosynthesis in E. californica. While a preliminary characterization confirmed that columbamine (oxidized product of THC) was produced in transgenic E. californica cells, many newly found peaks were not identified. Here, we report the identification of novel products, including allocryptopine and 10-hydroxychelerythrine. This result indicates that CjSMT reaction products were further converted by endogenous enzymes to produce double O-methylated compounds instead of a methylenedioxy ring at the 7,8-position of the original benzophenanthridine alkaloids. Further metabolite profiling revealed the enhanced diversification of the alkaloid profile in transgenic cells. Metabolic plasticity and the enzymes involved in metabolic diversity are discussed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,076
Score d'incertitude au seuil0,198

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,197
Écart entre enseignants0,190 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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