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Enregistrement W2108281485 · doi:10.1534/genetics.104.035691

A Genetic Screen for Suppressors of Drosophila NSF2 Neuromuscular Junction Overgrowth

2005· article· en· W2108281485 sur OpenAlexaff
Matthew Laviolette, Paula Nunes, Jean‐Baptiste Peyre, Toshiro Aigaki, Bryan A. Stewart

Notice bibliographique

RevueGenetics · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurobiology and Insect Physiology Research
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyNeuromuscular junctionGenePhenotypeGeneticsGenetic screenCell biologyTransgeneSynapseDrosophilidaeDrosophila melanogasterNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Drosophila larval neuromuscular system serves as a valuable model for studying the genes required for synaptic development and function. N-Ethylmaleimide sensitive factor (NSF) is a molecule known to be important in vesicular trafficking but neural expression of a dominant negative form of NSF2 induces an unexpected overgrowth of the Drosophila larval neuromuscular synapse. We have taken a genetic approach to understanding this novel phenotype by conducting a gain-of-function modifier screen to isolate genes that interact with the overgrowth phenotype. Our approach was to directly visualize the neuromuscular junction (NMJ) using a GFP transgene and screen for suppressors of NMJ overgrowth using the Gene Search collection of P-element insertions. Of the 3000 lines screened, we identified 99 lines that can partially restore the normal phenotype. Analysis of the GS element insertion sites by inverse PCR and comparison of the flanking DNA sequence to the Drosophila genome sequence revealed nearby genes for all but 10 of the 99 lines. The recovered genes, both known and predicted, include transcription factors, cytoskeletal elements, components of the ubiquitin pathway, and several signaling molecules. This collection of genes that suppress the NSF2 neuromuscular junction overgrowth phenotype is a valuable resource in our efforts to further understand the role of NSF at the synapse.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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