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Keratin 23 (K23), a novel acidic keratin, is highly induced by histone deacetylase inhibitors during differentiation of pancreatic cancer cells

2001· article· en· W2108373473 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueGenes Chromosomes and Cancer · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSkin and Cellular Biology Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Cancer InstitutePublic Health Agency of CanadaMayo Foundation for Medical Education and Research
Mots-clésMolecular biologyBiologyTrichostatin AHistone deacetylase inhibitorHistone deacetylaseHistoneGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sodium butyrate (NaBu) was shown to induce differentiation and apoptosis in the human pancreatic cancer cell line AsPC-1. A suppression subtractive hybridization-based technique was used to identify genes induced by NaBu. A novel cDNA was found to be highly up-regulated in AsPC-1 cells in response to NaBu. The gene expresses a 1.65-kb mRNA encoding a protein with an open reading frame of 422 amino acids. It has an intermediate filament signature sequence and extensive homology to type I keratins. Sequence comparison with known keratins indicated that the gene shares 42-46% amino acid identity and 60-65% similarity within the alpha-helical rod domain. The gene is named K23 (for human type I Keratin 23, KRT23). K23 mRNA was highly induced by NaBu in different pancreatic cancer cells. Trichostatin A (TSA), a potent and specific inhibitor of histone deacetylase, similarly induced K23 mRNA expression. Treatment with either actinomycin D or cycloheximide efficiently blocked the induction of K23 mRNA by NaBu/TSA. These results indicate that K23 mRNA induction by NaBu or TSA is a downstream event of histone hyperacetylation. We also demonstrated that expression of p21(WAF1/CIP1) antisense RNA efficiently blocked the induction of K23 mRNA induced by NaBu. Our results suggest that K23 is a novel member of the acidic keratin family that is induced in pancreatic cancer cells undergoing differentiation by a mechanism involving histone hyperacetylation. p21(WAF1/CIP1) serves as an important mediator during the induction process of K23 by NaBu.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,854

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle