Both the folate cycle and betaine‐homocysteine methyltransferase contribute methyl groups for DNA methylation in mouse blastocysts
Notice bibliographique
Résumé
The embryonic pattern of global DNA methylation is first established in the inner cell mass (ICM) of the mouse blastocyst. The methyl donor S ‐adenosylmethionine (SAM) is produced in most cells through the folate cycle, but only a few cell types generate SAM from betaine ( N,N,N ‐trimethylglycine) via betaine‐homocysteine methyltransferase (BHMT)' which is expressed in the mouse ICM. Here, mean ICM cell numbers decreased from 18‐19 in controls to 11‐13 when the folate cycle was inhibited by the antifolate methotrexate and to 12‐14 when BHMT expression was knocked down by antisense morpholinos. Inhibiting both pathways, however, much more severely affected ICM development (7‐8 cells). Total SAM levels in mouse blastocysts decreased significantly only when both pathways were inhibited (from 3.1 to 1.6 pmol/100 blastocysts). DNA methylation, detected as 5‐methylcytosine (5‐MeC) immunofluorescence in isolated ICMs, was minimally affected by inhibition of either pathway alone but decreased by at least 45‐55% when both BHMT and the folate cycle were inhibited simultaneously. Effects on cell numbers and 5‐MeC levels in the ICM were completely rescued by methionine (immediate SAM precursor) or SAM. Both the folate cycle and betaine/BHMT appear to contribute to a methyl pool required for normal ICM development and establishing initial embryonic DNA methylation.—Zhang, B., Denomme, M.M., White, C. R., Leung, K.‐Y., Lee, M. B., Greene, N. D. E. Mann, M. R. W. Trasler, J. M., Baltz, J. M., Both the folate cycle and betaine‐homocysteine methyltransferase contribute methyl groups for DNA methylation in mouse blastocysts. FASEB J. 29, 1069–1079 (2015). www.fasebj.org
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,006 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».