Maternal allergen exposure reprograms the developmental lung transcriptome in atopic and normoresponsive rat pups
Notice bibliographique
Résumé
The "fetal origins hypothesis" argued that physiological changes consequent to in utero exposures ultimately contribute to disease susceptibility in later life. The dramatic increase in asthma prevalence is attributed to early exposures acting on preexisting asthma-susceptible genotypes. We showed previously that distinct transcriptome signatures distinguish the developmental respiratory phenotype of atopic (Brown Norway, BN) and normoresponsive (Lewis) rats. We aimed to determine whether maternal allergen exposure would influence asthma pathogenesis by reprogramming primary patterns of developmental lung gene expression. Postnatal offspring of dams sensitized to ovalbumin before mating and challenged during pregnancy were assessed for lung function, inflammatory biomarkers, and respiratory gene expression. Although maternal ovalbumin exposure resulted in characteristic features of an allergic response (bronchoalveolar lavage neutrophils, IgE, methacholine-induced lung resistance) in offspring of both strains, substantial strain-specific differences were observed in respiratory gene expression. Of 799 probes representing the top 5% of transcriptomic variation, only 112 (14%) were affected in both strains. Strain-specific gene signatures also exhibited marked differences in enrichment for gene ontologies, with immune regulation and cell proliferation being prominent in the BN strain, cell cycle and microtubule assembly gene sets in the Lewis strain. Multiple ovalbumin-specific probes in both strains were also differentially expressed in lymphoblastoid cell lines from human asthmatic vs. nonasthmatic sibling pairs. Our data point to the existence of distinct, genetically programmed responses to maternal exposures in developing lung. These different response patterns, if recapitulated in human fetal development, can contribute to long-term pulmonary health including interindividual susceptibility to asthma.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».