MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2108575147 · doi:10.1093/hmg/ddu545

Deleterious mutations in the essential mRNA metabolism factor, hGle1, in amyotrophic lateral sclerosis

2014· article· en· W2108575147 sur OpenAlexafffund
Hannah Kaneb, Andrew W. Folkmann, Véronique Belzil, Li-En Jao, Claire S. Leblond, Simon Girard, Hussein Daoud, Anne Noreau, Daniel Rochefort, Pascale Hince, Anna Szuto, Annie Levert, Sabrina Vidal, Catherine André-Guimont, William Camu, Jean-Pierre Bouchard, Nicolas Dupré, Guy A. Rouleau, Susan R. Wente, Patrick A. Dion

Notice bibliographique

RevueHuman Molecular Genetics · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeurogenetic and Muscular Disorders Research
Établissements canadiensCentre hospitalier universitaire de QuébecUniversité LavalUniversité de MontréalMcGill UniversityCentre Hospitalier de l’Université de MontréalMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of General Medical SciencesMarch of Dimes FoundationNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésAmyotrophic lateral sclerosisBiologyMissense mutationGeneticsMotor neuronZebrafishMutationNonsense mutationC9orf72GeneTrinucleotide repeat expansionPathologyDiseaseNeuroscienceMedicineAlleleSpinal cord

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) is a fatal neurodegenerative disorder characterized by the selective death of motor neurons. Causative mutations in the global RNA-processing proteins TDP-43 and FUS among others, as well as their aggregation in ALS patients, have identified defects in RNA metabolism as an important feature in this disease. Lethal congenital contracture syndrome 1 and lethal arthrogryposis with anterior horn cell disease are autosomal recessive fetal motor neuron diseases that are caused by mutations in another global RNA-processing protein, hGle1. In this study, we carried out the first screening of GLE1 in ALS patients (173 familial and 760 sporadic) and identified 2 deleterious mutations (1 splice site and 1 nonsense mutation) and 1 missense mutation. Functional analysis of the deleterious mutants revealed them to be unable to rescue motor neuron pathology in zebrafish morphants lacking Gle1. Furthermore, in HeLa cells, both mutations caused a depletion of hGle1 at the nuclear pore where it carries out an essential role in nuclear export of mRNA. These results suggest a haploinsufficiency mechanism and point to a causative role for GLE1 mutations in ALS patients. This further supports the involvement of global defects in RNA metabolism in ALS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,300
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations130
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueHuman Molecular GeneticsMême sujetNeurogenetic and Muscular Disorders ResearchTravaux en français237 207