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Enregistrement W2108585045 · doi:10.1099/vir.0.008466-0

Human cytomegalovirus US9 protein contains an N-terminal signal sequence and a C-terminal mitochondrial localization domain, and does not alter cellular sensitivity to apoptosis

2009· article· en· W2108585045 sur OpenAlexaff
Lana Mandic, Matthew S. Miller, Corinne Coulter, Brian Munshaw, Laura Hertel

Notice bibliographique

RevueJournal of General Virology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCytomegalovirus and herpesvirus research
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesEberhard Karls Universität Tübingen
Mots-clésBiologyTransmembrane domainMolecular biologyEndoplasmic reticulumCell biologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The human cytomegalovirus (CMV) US2-US11 genomic region contains a cluster of genes whose products interfere with antigen presentation by the major histocompatibility complex (MHC) proteins. Although included in this cluster, the US9 gene encodes a glycoprotein that does not affect MHC activity and whose function is still largely uncharacterized. An in silico analysis of the US9 amino-acid sequence uncovered the presence of an N-terminal signal sequence (SS) and a C-terminal transmembrane domain containing the specific hallmarks of known mitochondrial localization sequences (MLS). Expression of full-length US9 and of US9 deletion mutants fused to GFP revealed that the N-terminal SS mediates US9 targeting to the endoplasmic reticulum (ER) and that the C-terminal MLS is both necessary and sufficient to direct US9 to mitochondria in the absence of a functional SS. This dual localization suggested a possible role for US9 in protection from apoptosis triggered by ER-to-mitochondria signalling. Fibroblasts infected with the US2-US11 deletion mutant virus RV798 or with the parental strain AD169varATCC were equally susceptible to death triggered by exposure to tumour necrosis factor (TNF)-alpha, tunicamycin, thapsigargin, brefeldin A, lonidamine and carbonyl cyanide m-chloro phenyl hydrazone, but were 1.6-fold more sensitive to apoptosis induced by hygromycin B. Expression of US9 in human embryonic kidney 293T cells or in fibroblasts, however, did not protect cells from hygromycin B-mediated death. Together, these results classify US9 as the first CMV-encoded protein to contain an N-terminal SS and a C-terminal MLS, and suggest a completely novel role for this protein during infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,067
Score d'incertitude au seuil0,857

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,321
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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