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Enregistrement W2108690301 · doi:10.1128/aac.01751-09

Cadaverine Suppresses Persistence to Carboxypenicillins in <i>Pseudomonas aeruginosa</i> PAO1

2010· article· en· W2108690301 sur OpenAlexafffund
Jerrylynn Manuel, George G. Zhanel, Teresa de Kievit

Notice bibliographique

RevueAntimicrobial Agents and Chemotherapy · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésCarbenicillinCadaverineTicarcillinMicrobiologyPseudomonas aeruginosaLysine decarboxylaseBiologyMutantMultidrug toleranceChemistryBiochemistryAntibioticsBacteriaGeneSpermidineAmpicillinEnzymeBiofilmGeneticsImipenemAntibiotic resistance

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The refractory nature of Pseudomonas aeruginosa infections is due in part to the presence of specialized cells, termed persisters, within the population. To identify genes involved in P. aeruginosa persister formation, a PAO1 transposon (Tn) library was challenged en masse with 1,000 μg/ml of carbenicillin and was enriched for mutants that were able to survive in the presence of this antibiotic. For one mutant that was further characterized, the carbenicillin MIC was equal to that of PAO1, but persister formation exhibited a 20-fold increase after exposure to the antibiotic. Sequence analysis revealed that the Tn had inserted into PA4115, a gene encoding a putative lysine decarboxylase. A PA4115 mutant that produced 48-fold and 20-fold more survivors than PAO1 after 10-h exposures to carbenicillin and ticarcillin, respectively, was generated by allelic exchange. Furthermore, the rate of carboxypenicillin-induced lysis was reduced in the PA4115 mutant. Under certain pH conditions, lysine decarboxylase converts lysine to cadaverine. By measuring cadaverine production, we discovered that the PA4115 mutant had significantly reduced lysine decarboxylase activity. To determine if reduced cadaverine levels are responsible for the increase in carbenicillin and ticarcillin persistence, viability and lysis assays were performed in the presence of exogenous cadaverine. Cadaverine increased the rate of killing and lysis of the PA4115 mutant in the presence of both antibiotics. These findings suggest that cadaverine may be able to enhance the effectiveness of carboxypenicillins against P. aeruginosa by reducing persister formation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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