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Enregistrement W2108703975 · doi:10.1002/qsar.200530003

Use of Quantitative Structure-activity Relationship to Model the Photoinduced Toxicity of Anthracene and Oxygenated Anthracenes

2005· article· en· W2108703975 sur OpenAlex
Ali Mallakin, Paul G. Mezey, Zbigniew Zimpel, Kenneth S. Berenhaut, Bruce M. Greenberg, D. George Dixon

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueQSAR & Combinatorial Science · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueComputational Drug Discovery Methods
Établissements canadiensUniversity of WaterlooUniversity of SaskatchewanMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAnthraceneChemistryAnthraquinoneChemical structureQuantitative structure–activity relationshipPhotosynthesisMoleculeToxicityStereochemistryOrganic chemistryBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) are known to exhibit photoinduced toxicity to organisms, especially in the presence of ultraviolet irradiation. Oxidation is the most common photochemical reaction of anthracene (ANT) and ANT derivatives. Quinones, hydroxy-quinones, diols, and aldehydes are the resultant products. Different ANT photoproducts have different impact on biological organisms. The structure of these molecules contains information concerning their toxicity. From two main bioenergetic pathways in aerobic organisms (respiration and photosynthesis), we have previously reported the inhibition of photosynthesis by ANT derivatives. We showed that inhibition of photosynthesis is a reliable assay of xenobiotic stress. To study the correlation between chemical structures and toxicity, precise structure of anthracene (ANT), anthraquinone (ATQ) and eleven hydroxyanthraquinones (hATQs) were constructed. A numerical comparison of molecular shape codes was used for shape comparison and similarity analysis. The data sets for growth inhibition showed good correlations to the shape similarity. Both the one ring and whole molecule similarities of ANT, ATQ and hATQs showed a good correlation with the empirical whole organism toxicity data. The IC50 values for FV/FM and FQ/FM were plotted against hyperbolic dependencies of one-ring and whole molecule similarity to determine their predictive capacity. The two data sets for FQ/FM and FV/FM have reasonable regression coefficients, and both were found to be excellent bioindicators of effects. In this study correlation between the shape of chemicals and the biological activity provides necessary information related to toxicity of hazard chemicals based on chemical and biological properties of their reactions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,478
Score d'incertitude au seuil0,500

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,083
Tête enseignante GPT0,351
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle