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Enregistrement W2108862374 · doi:10.1007/s00401-013-1198-2

TERT promoter mutations are highly recurrent in SHH subgroup medulloblastoma

2013· article· en· W2108862374 sur OpenAlexafffund
Marc Remke, Vijay Ramaswamy, John Peacock, David Shih, Christian Koelsche, Paul A. Northcott, Nadia Hill, Florence M.G. Cavalli, Marcel Kool, Xin Wang, Stephen C. Mack, Mark Barszczyk, A. Sorana Morrissy, Xiaochong Wu, Sameer Agnihotri, Betty Luu, David Jones, Livia Garzia, Adrian M. Dubuc, Nataliya Zhukova, Robert J. Vanner, Johan M. Kros, Pim J. French, Erwin G. Van Meir, Rajeev Vibhakar, Karel Zitterbart, Jennifer A. Chan, László Bognár, Álmos Klekner, Bolesław Lach, Shin Jung, Ali G. Saad, Linda M. Liau, Steffen Albrecht, Massimo Zollo, Michael K. Cooper, Reid C. Thompson, Olivier Delattre, Franck Bourdeaut, François Doz, Miklós Garami, Péter Hauser, Carlos Gilberto Carlotti, Timothy Van Meter, Luca Massimi, Daniel W. Fults, Scott L. Pomeroy, Toshiro Kumabe, Young Shin, Jeffrey R. Leonard, Samer K. Elbabaa, Jaume Mora, Joshua B. Rubin, Yoon‐Jae Cho, Roger E. McLendon, Darell D. Bigner, Charles G. Eberhart, Maryam Fouladi, Robert J. Wechsler‐Reya, Cláudia C. Faria, Sidney Croul, Annie Huang, Éric Bouffet, Cynthia Hawkins, Peter B. Dirks, William A. Weiss, Ulrich Schüller, Ian F. Pollack, Stefan Rutkowski, David Meyronet, Anne Jouvet, Michelle Fèvre‐Montange, Nada Jabado, Marta Perek‐Polnik, Wiesława Grajkowska, Seung‐Ki Kim, James T. Rutka, David Malkin, Uri Tabori, Stefan M. Pfister, Andrey Korshunov, Andreas von Deimling, Michael D. Taylor

Notice bibliographique

RevueActa Neuropathologica · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversity of CalgaryMcMaster UniversityUniversity of TorontoSickKids FoundationHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentPediatric Brain Tumor FoundationCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of TorontoNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthAlberta InnovatesHospices Civils de LyonHospital for Sick ChildrenDeutsche KrebshilfeNational Institute of Neurological Disorders and StrokeMagyar Tudományos Akadémia
Mots-clésMedulloblastomaBiologyWnt signaling pathwayCancer researchMutationPoint mutationGeneticsTelomeraseIsochromosomeTelomerase reverse transcriptaseGeneChromosomeKaryotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Telomerase reverse transcriptase (TERT) promoter mutations were recently shown to drive telomerase activity in various cancer types, including medulloblastoma. However, the clinical and biological implications of TERT mutations in medulloblastoma have not been described. Hence, we sought to describe these mutations and their impact in a subgroup-specific manner. We analyzed the TERT promoter by direct sequencing and genotyping in 466 medulloblastomas. The mutational distributions were determined according to subgroup affiliation, demographics, and clinical, prognostic, and molecular features. Integrated genomics approaches were used to identify specific somatic copy number alterations in TERT promoter-mutated and wild-type tumors. Overall, TERT promoter mutations were identified in 21 % of medulloblastomas. Strikingly, the highest frequencies of TERT mutations were observed in SHH (83 %; 55/66) and WNT (31 %; 4/13) medulloblastomas derived from adult patients. Group 3 and Group 4 harbored this alteration in <5 % of cases and showed no association with increased patient age. The prognostic implications of these mutations were highly subgroup-specific. TERT mutations identified a subset with good and poor prognosis in SHH and Group 4 tumors, respectively. Monosomy 6 was mostly restricted to WNT tumors without TERT mutations. Hallmark SHH focal copy number aberrations and chromosome 10q deletion were mutually exclusive with TERT mutations within SHH tumors. TERT promoter mutations are the most common recurrent somatic point mutation in medulloblastoma, and are very highly enriched in adult SHH and WNT tumors. TERT mutations define a subset of SHH medulloblastoma with distinct demographics, cytogenetics, and outcomes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,248
Score d'incertitude au seuil0,653

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations167
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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