Golgi α-mannosidase II cleaves two sugars sequentially in the same catalytic site
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
Golgi alpha-mannosidase II (GMII) is a key glycosyl hydrolase in the N-linked glycosylation pathway. It catalyzes the removal of two different mannosyl linkages of GlcNAcMan(5)GlcNAc(2), which is the committed step in complex N-glycan synthesis. Inhibition of this enzyme has shown promise in certain cancers in both laboratory and clinical settings. Here we present the high-resolution crystal structure of a nucleophile mutant of Drosophila melanogaster GMII (dGMII) bound to its natural oligosaccharide substrate and an oligosaccharide precursor as well as the structure of the unliganded mutant. These structures allow us to identify three sugar-binding subsites within the larger active site cleft. Our results allow for the formulation of the complete catalytic process of dGMII, which involves a specific order of bond cleavage, and a major substrate rearrangement in the active site. This process is likely conserved for all GMII enzymes-but not in the structurally related lysosomal mannosidase-and will form the basis for the design of specific inhibitors against GMII.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle