Structural basis for red cell phenotypic changes in newly identified, naturally occurring subgroup mutants of the human blood group B glycosyltransferase
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Four amino-acid-changing polymorphisms differentiate the blood group A and B alleles. Multiple missense mutations are associated with weak expression of A and B antigens but the structural changes causing subgroups have not been studied. STUDY DESIGN AND METHODS: Individuals or families having serologically weak B antigen on their red cells were studied. Alleles were characterized by sequencing of exons 1 through 7 in the ABO gene. Single crystal X-ray diffraction, three-dimensional-structure molecular modeling, and enzyme kinetics showed the effects of the B allele mutations on the glycosyltransferases. RESULTS: Seven unrelated individuals with weak B phenotypes possessed seven different B alleles, five of which are new and result in substitution of highly conserved amino acids: M189V, I192T, F216I, D262N, and A268T. One of these (F216I) was due to a hybrid allele resulting from recombination between B and O(1v) alleles. The two other alleles were recently described in other ethnic groups and result in V175M and L232P. The first crystal-structure determination (A268T) of a subgroup glycosyltransferase and molecular modeling (F216I, D262N, L232P) indicated conformational changes in the enzyme that could explain the diminished enzyme activity. The effect of three mutations could not be visualized since they occur in a disordered loop. CONCLUSION: The genetic background for B(w) phenotypes is very heterogeneous but usually arises through seemingly random missense mutations throughout the last ABO exon. The targeted amino acid residues, however, are well conserved during evolution. Based on analysis of the resulting structural changes in the glycosyltransferase, the mutations are likely to disrupt molecular bonds of importance for enzymatic function.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».