Bacterial Catalase in the Microsporidian <i>Nosema locustae</i> : Implications for Microsporidian Metabolism and Genome Evolution
Notice bibliographique
Résumé
Microsporidia constitute a group of extremely specialized intracellular parasites that infect virtually all animals. They are highly derived, reduced fungi that lack several features typical of other eukaryotes, including canonical mitochondria, flagella, and peroxisomes. Consistent with the absence of peroxisomes in microsporidia, the recently completed genome of the microsporidian Encephalitozoon cuniculi lacks a gene for catalase, the major enzymatic marker for the organelle. We show, however, that the genome of the microsporidian Nosema locustae, in contrast to that of E. cuniculi, encodes a group II large-subunit catalase. Surprisingly, phylogenetic analyses indicate that the N. locustae catalase is not specifically related to fungal homologs, as one would expect, but is instead closely related to proteobacterial sequences. This finding indicates that the N. locustae catalase is derived by lateral gene transfer from a bacterium. The catalase gene is adjacent to a large region of the genome that appears to be far less compact than is typical of microsporidian genomes, a characteristic which may make this region more amenable to the insertion of foreign genes. The N. locustae catalase gene is expressed in spores, and the protein is detectable by Western blotting. This type of catalase is a particularly robust enzyme that has been shown to function in dormant cells, indicating that the N. locustae catalase may play some functional role in the spore. There is no evidence that the N. locustae catalase functions in a cryptic peroxisome.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».