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Enregistrement W2109328764 · doi:10.1128/aac.00064-12

Inhibition of Bacterial Biofilm Formation and Swarming Motility by a Small Synthetic Cationic Peptide

2012· article· en· W2109328764 sur OpenAlexafffund
César de la Fuente‐Núñez, Victoria Korolik, Manjeet Bains, Uyen Nguyen, Elena B. M. Breidenstein, Shawn R Horsman, Shawn Lewenza, Lori L. Burrows, Robert E. W. Hancock

Notice bibliographique

RevueAntimicrobial Agents and Chemotherapy · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAntimicrobial Peptides and Activities
Établissements canadiensUniversity of CalgaryMcMaster UniversityUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiofilmMicrobiologySwarming motilityPseudomonas aeruginosaPeptideQuorum sensingBiologyBacteriaSwarming (honey bee)AntimicrobialChemistryBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Biofilms cause up to 80% of infections and are difficult to treat due to their substantial multidrug resistance compared to their planktonic counterparts. Based on the observation that human peptide LL-37 is able to block biofilm formation at concentrations below its MIC, we screened for small peptides with antibiofilm activity and identified novel synthetic cationic peptide 1037 of only 9 amino acids in length. Peptide 1037 had very weak antimicrobial activity, but at 1/30th the MIC the peptide was able to effectively prevent biofilm formation (>50% reduction in cell biomass) by the Gram-negative pathogens Pseudomonas aeruginosa and Burkholderia cenocepacia and Gram-positive Listeria monocytogenes. Using a flow cell system and a widefield fluorescence microscope, 1037 was shown to significantly reduce biofilm formation and lead to cell death in biofilms. Microarray and follow-up studies showed that, in P. aeruginosa, 1037 directly inhibited biofilms by reducing swimming and swarming motilities, stimulating twitching motility, and suppressing the expression of a variety of genes involved in biofilm formation (e.g., PA2204). Comparison of microarray data from cells treated with peptides LL-37 and 1037 enabled the identification of 11 common P. aeruginosa genes that have a role in biofilm formation and are proposed to represent functional targets of these peptides. Peptide 1037 shows promise as a potential therapeutic agent against chronic, recurrent biofilm infections caused by a variety of bacteria.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations459
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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